Proton vs Electron ist ein Strategiespiel, das Spieler versuchen, Rätsel zu lösen, indem Proton und Elektronen richtig platziert werden. Spieler vervollständigen Ebenen, indem sie atomare Partikel in ausgewogener Weise führen. Ihr Ziel ist es, das Spiel zu beenden, indem Sie alle Atome so schnell wie möglich im Gleichgewicht halten.